抗菌藥不一定比別的藥副作用大，但是其使用機會多和使用人群廣，因此，發生副作用的病例也就相對多些。其中，抗菌藥對肝功能影響就是需要注意的問題。以下例舉的抗菌藥(均為通用名)都有引起肝功能障礙的報道，雖然并不多見，但也應在使用過程密切注意，必要時應進行肝功能檢查。特別是已有肝功能障礙患者應慎重使用。

 
　　青霉素類天然型青霉素比合成型青霉素(如阿莫西林、氨芐西林、哌拉西林等)引起肝功能障礙少見。青霉素引起肝功能障礙主要表現用藥后出現發熱、皮膚發紅等過敏現象。出現此種情況應立即檢查肝功。如有異常，立即改用其他抗菌藥。有報阿莫西林/克拉維酸鉀合劑可引起重癥肝功能障礙而導致死亡。

 
　　頭孢菌素通過變態反應引起肝功能障礙。臨床并不多見，輕度反應可出現短時轉氨酶升高。但迄今已有因使用頭孢唑林、頭孢替安和頭孢美唑引起需要住院治療的肝功能障礙的患者。有報道，頭孢曲松可引起嚴重肝功能障礙。

 
　　紅霉素類發生肝功能障礙比較少見，如發生，多在用藥后數日至20日前后。喹諾酮類極個別引起嚴重肝功能障礙，多發生在用藥早期。氨基糖苷類抗生素引起肝功能障礙者少見，個別情況如阿米卡星、慶大霉素、卡那霉素和妥布霉素有引起肝功能障礙的報道。

 
　　四環素類靜脈注射超過1.5克，相當一部分患者可出現肝功能障礙，特別是腎功能障礙患者更為危險。少量長期口服四環素可引起肝功能障礙，并有持續黃膽，多發生在用藥5周以內(長期使用四環素治療青春痘要注意)。用藥1年以上有引起自身免疫性肝炎的危險。另外，據世界衛生組織報道，因使用米諾環素(二甲胺四環素)可有6%的人出現肝功能障礙，多發生在用藥后3周到數月。